Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FBXO42Q6P3S6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms