Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LETMD1Q6P1Q0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LETMD1Q6P1Q0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms