Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRAMEF20Q5VT98 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms