Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC01545Q5VT33 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms