Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CEP170Q5SW79 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEP170Q5SW79 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms