Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms