Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LAMA3Q16787 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
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