Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNAPC1Q16533 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNAPC1Q16533 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SNAPC1Q16533 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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