Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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