Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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SYCP1Q15431 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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SYCP1Q15431 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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