Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PUM3Q15397 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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