Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RAB35Q15286 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RAB35Q15286 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RAB35Q15286 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RAB35Q15286 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RAB35Q15286 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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RAB35Q15286 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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RAB35Q15286 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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RAB35Q15286 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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RAB35Q15286 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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RAB35Q15286 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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RAB35Q15286 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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