Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCARF1Q14162 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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