Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNC3Q14003 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNC3Q14003 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNC3Q14003 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNC3Q14003 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNC3Q14003 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNC3Q14003 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNC3Q14003 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNC3Q14003 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNC3Q14003 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNC3Q14003 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNC3Q14003 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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KCNC3Q14003 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KCNC3Q14003 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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