Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ALCAMQ13740 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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