Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
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IRF5Q13568 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF5Q13568 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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