Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ATRQ13535 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ATRQ13535 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ATRQ13535 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ATRQ13535 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ATRQ13535 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
ATRQ13535 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ATRQ13535 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ATRQ13535 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ATRQ13535 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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