Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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TUBB3Q13509 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUBB3Q13509 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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TUBB3Q13509 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TUBB3Q13509 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUBB3Q13509 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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