Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM28Q13263 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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