Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME3Q13232 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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