Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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