Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXC1Q12948 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms