Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAPQ12770 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCAPQ12770 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms