Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GABPB1Q06547 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms