Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALD1Q05682 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms