Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPN12Q05209 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms