Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CSNK2BP67870 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CSNK2BP67870 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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CSNK2BP67870 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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CSNK2BP67870 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSNK2BP67870 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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