Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
HERVK_113P63121 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms