Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms