Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GSCP56915 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GSCP56915 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GSCP56915 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSCP56915 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms