Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GFRA1P56159 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GFRA1P56159 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GFRA1P56159 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GFRA1P56159 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GFRA1P56159 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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GFRA1P56159 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GFRA1P56159 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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