Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRB2P47870 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms