Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA3P42263 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA3P42263 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA3P42263 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA3P42263 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA3P42263 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA3P42263 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA3P42263 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA3P42263 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA3P42263 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIA3P42263 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRIA3P42263 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms