Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC26A3P40879 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms