Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NUP214P35658 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms