Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CTSSP25774 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CTSSP25774 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CTSSP25774 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CTSSP25774 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CTSSP25774 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CTSSP25774 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CTSSP25774 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CTSSP25774 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CTSSP25774 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CTSSP25774 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CTSSP25774 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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