Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5A1P25705 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms