Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRPH2P23942 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms