Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GP1BBP13224 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms