Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COL6A2P12110 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms