Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAMC1P11047 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAMC1P11047 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms