Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00032P0C843 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms