Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SERPIND1P05546 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms