Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4FO95754 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms