Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NIPSNAP2O75323 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms