Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPHP4O75161 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPHP4O75161 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms