Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUX1O43812 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUX1O43812 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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