Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXC11O43248 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXC11O43248 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms