Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRTO14522 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRTO14522 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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