Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
E9PBE3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E9PBE3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E9PBE3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms